Действительный член РАН (2013), действи­тельный член PАМН (2007), член-корреспондент РАМН (2004), доктор медицинских наук (1999), профессор. Нейро­фи­зи­олог.

Научная деятельность Л. И. Афтанаса посвя­щена изучению нейрофизиологических меха­низмов эмоций у человека и их роли в дея­тель­ности мозга.

Окончил лечебный факультет Ивано-Фран­ковского государственного медицинского института (1979). До 1982 года работал врачом психиатром и функциональной диагностики Кустанайской областной психиатрической больницы. Аспирант, младший и старший научый сотрудник, зав. лабораторией психофизиологии, зам. директора по научной работе НИИ физиологии Сибирского отделения РАМН (1982–2012).

С 2012 г. — по настоящее время — зав. Отделом экспериментальной и клинической нейронауки, зав. лабораторией аффективной, когнитивной и трансляционной нейронауки, научный руководитель Психотерапевтического отделения клиники, директор ФГБНУ «Научно-исследовательский институт физиологии и фундаментальной медицины».

Вице-президент РАМН и член Президиума РАМН, председатель СО РАМН (2011–2013). Член Президиума РАН, зам. Председателя СО РАН (с 2013).

Член Бюро Отделения медицинских наук РАН, зав. кафедрой нейронаук Института медицины и психологии Новосибирского государственного университета, научный руководитель Стратегической академической единицы НГУ «Нейронауки в трансляционной медицине», зав. лабораторией трансля­ционной и клинической нейронауки Института медицины и психологии НГУ.

Вице-президент Международного Союза по Приполярной Медицине (International Union for Circumpolar Health — IUCH).

Автор более 250 научных работ.

Лауреат премии Президиума РАМН «За лучшую фундаментальную работу в медицине» (2001).

Имеет государственные награды.