В годы Великой Отечественной войны был главным консультантом эвакогоспиталей Новосибирска. Участвовал в работе госпитальных и межгоспитальных конференций и областного госпитального совета. К концу войны Владимир Михайлович выпустил книгу «К истории военной хирургии» и второй том «Очерков хирургической диагностики: опухоли живота», которые явились ценным диагностическим пособием.

Награжден орденом Трудового Красного Знамени (1942), медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.» (1946).

Источники:

• Мыш Владимир Михайлович // Томск от А до Я: краткая энциклопедия города. Томск: Издательство НТЛ, 2004. С. 220.
• Профессора медицинского факультета Томского университета — Томского медицинского института — Сибирского государственного медицинского университета (1878–2003): биографический словарь. Т. 1 / С. Ф. Фоминых, С. А. Некрылов, М. В. Грибовский, Г. И. Мендрина, А. И. Венгеровский, В. В. Новицкий. Томск: Издательство Томского университета, 2004.
• Созидатели: очерки о людях, вписавших свое имя в историю Новосибирска: в 2-х т. Новосибирск: Клуб меценатов, 2003. Т. 2. С. 338–346.
• Шиков Г. Т. Выдающийся хирург и ученый (В. М. Мыш) // Юбилейный сборник, посвященный заслуженному деятелю науки действительному члену Академии медицинских наук СССР В. М. Мыш. 50 лет. 1895–1945. Новосибирск, 1947. Т. 25. С. 4–17.