Prat D. Analyse du ge'nome et gestion des resources ge'ne'tiques forestieres / Prat D., Rampant F., Prado E. - Paris: Inra, 2006. - vii, 456 p. - ISBN 2-7380-1227-2  Место хранения:   06 | Якутский научный центр СО РАН | Якутск | Центральная научная библиотека Якутского научного центра СО РАН

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L'evaluation des ressources genetiques: l'analyse du polymorphisme ...................................... 1 Conservation des ressources genetiques forestieres .............. 1 Classification des arbres forestiers ............................ 4 Organisation des genomes des arbres forestiers .................. 6 Le genome nucleaire ............................................. 8 •Caryotype et ploÏdie ......................................... 10 •Taille du genome ............................................. 12 •Organisation et expression d'un gene ......................... 12 •Families de genes ............................................ 15 •ADN repete ................................................... 20 Le genome chloroplastique ...................................... 25 Le genome mitochondrial ........................................ 32 L evolution des genomes ........................................ 35 Variabilite genetique des arbres forestiers .................... 43 Ampleur de la variabilite ...................................... 43 Evolution de la variabilite au cours des generations ........... 44 Flux de genes .................................................. 46 L'interet des marqueurs genetiques ............................. 4l Informations attendues des marqueurs ........................... 47 Parametres decrivant la variabilite genetique .................. 49 •Structure intrapopulation .................................... 50 Parametres de diversite ...................................... 50 Desequilibre de liaison ...................................... 52 Regime de reproduction ....................................... 53 Structure spatiale ........................................... 55 Taille de population ......................................... 55 •Structure interpopulation .................................... 56 Differenciation entre sous-populations ....................... 56 Flux geniques ................................................ 60 Distances genetiques ......................................... 61 Phylogeographie .............................................. 66 Relations entre marqueurs genetiques et caracteres quantitatifs ................................................... 67 •Carte genetique .............................................. 67 •Localisation des genes majeurs ............................... 69 Les outils d'analyse ........................................... 73 Les marqueurs genetiques ....................................... 73 Principes et generalites ...................................... 73 Marqueurs morphologiques ...................................... 74 Marqueurs biochimiques ........................................ 75 •Produits du metabolisme secondaire ........................... 75 •Isoenzymes ................................................... 76 •Proteines totales ............................................ 77 Marqueurs moleculaires ......................................... 81 •Mise en evidence du polymorphisme ............................ 81 Restriction par des endonucleases ............................ 82 Hybridation .................................................. 84 Amplification genique ........................................ 85 Structure de l'ADN ........................................... 87 Sequence d'ADN ............................................... 90 •Description des marqueurs moleculaires ....................... 92 RFLP ......................................................... 92 Marqueurs derives de la PCR .................................. 95 AFLPТM et techniques derivees ............................... 113 Marqueurs semi-spicifiques .................................. 116 Autres marqueurs ............................................ 117 •Marqueurs moleculaires de sequences exprimees ............... 118 •Polymorphisme de nucleotide unique (SNP) .................... 121 Reproductibilite .............................................. 124 •Effet du prelevement ou du tissu analyse .................... 124 •Difficultes techniques ...................................... 125 •Transfert entre laboratoires ................................ 128 Heredite ...................................................... 129 •Marqueurs du genome nucleaire ................................129 Determinisme genetique ...................................... 129 Dominance ................................................... 133 •Marqueurs des genomes cytoplasmiques .........................135 Automatisation et analyses .................................... 139 •Extraction et electrophorese ................................ 140 •Lecture de gels: analyse d'images ........................... 144 •PucesaADN ................................................... 146 Principe .................................................... 146 Applications ................................................ 148 •Programmes d'analyse de la diversite ........................ 151 Diversite et structure genetique ............................ 152 Taille de population ........................................ 157 Regime de reproduction ...................................... 157 Simulation .................................................. 158 Phylogenie .................................................. 158 Cartographie genetique ...................................... 160 Detection et localisation de QTL ............................ 162 Cytologic ..................................................... 164 Cytometric .................................................... 164 •Cytophotometrie ............................................. 165 •Cytometric en flux .......................................... 166 Cytogenetique ................................................. 168 •Hybridation in situ (HIS) ................................... 169 •Hybridation de genes {Fluorescent in situ hybridization, FISH) ........................................ 170 Structure chromosomique ..................................... 170 Genes ribosomiques .......................................... 171 Genes de sequence unique .................................... 171 Amorcage in situ ............................................ 172 •Hybridation de genome {Genome in situ hybridization, GISH) ........................................ 172 Applications et choix des marqueurs ........................... 175 Echantillonnage du genome ..................................... 176 Transfert des marqueurs entre especes ......................... 177 Adequation marqueur - objectif ................................ 181 Criteres de choix ............................................. 182 Utilisations et choix des marqueurs ........................... 192 •Identification genetique .................................... 197 •Phylogenie .................................................. 201 •Analyse et structuration de la variabilite genetique ........ 206 Structure et dijferenciation ................................ 206 Flux de genes ............................................... 213 Phylogeographie ............................................. 217 •Cartographie genetique et ses applications .................. 217 L'apport des marqueurs dans la gestion des ressources genetiques .................................................... 223 Systematique et phylogenie .................................... 223 Histoire des populations ...................................... 224 Introgression ................................................. 225 Influence de grandes variations environnementales anciennes ... 225 Gestion des ressources genetiques ............................. 229 Evaluation des ressources genetiques .......................... 230 •Variabilite et adaptation ................................... 230 •Flux de genes ............................................... 235 ANALYSE DU GENOME ET GESTION DES RESSOURCES GENETIQUES FORESTIERES Gestion de reseaux de populations in situ ..................... 238 •Influence de la sylviculture ................................ 238 •Constitution du reseau ...................................... 240 Choix des populations et contraintes climatiques ............ 240 Principes de gestion ........................................ 244 Illustrations ............................................... 246 •Especes disseminees ......................................... 248 •Especes menacees ............................................ 249 Ressources genetiques ex situ ................................. 251 •Echantillonnage ............................................. 252 •Choix des sites ............................................. 253 •Gestion ..................................................... 255 Conclusions ................................................... 259 Annexes ....................................................... 269 References bibliographiques ................................... 341 Glossaire ..................................................... 433 Index ......................................................... 453