8 февраля 1968 г. Президиум СО АН СССР принял решение о создании в составе Института экономики и организации промышленного производства СО АН СССР Иркутского отдела региональной экономики и размещения производительных сил Восточной Сибири. Инициатором его создания был академик А.Г.Аганбегян.

Отдел был создан в период масштабного индустриального освоения Восточной Сибири. Его сотрудники проводили широкий круг научно-экономических исследований, оказывали помощь региональным органам власти в проведении предплановых разработок и в экспертизе региональных программ.

Среди наиболее значимых разработок - исследования перспектив освоения Ангаро-Енисейского региона, комплексного освоения зоны БАМ, участие в обосновании Комплексной программы научно-технического прогресса Западно-Сибирского и Восточно-Сибирского экономических районов на 1991-2010 годы, разработка стратегии развития минерально-сырьевого комплекса Иркутской области (2011 г.) и т. д.

1 апреля 1998 г. отдел переименован в Лабораторию региональной экономики и размещения производительных сил Восточной Сибири ИЭиОПП СО РАН, которая в октябре 1998 г. включена в состав Отдела региональных и экономических проблем Иркутского научного центра СО РАН.